Снятая галочка — точка не поедет в маршрут. Красные и жёлтые — геокодер нашёл только улицу или населённый пункт, проверь на месте.

Навигатор получает точки уже в правильном порядке. Если Яндекс Навигатор не установлен — открой «Яндекс Карты», они предложат вести.